มะเร็งที่สำคัญที่สุดในบรรดามะเร็งที่เกิดจากการสูบบุหรี่คือมะเร็งปอด การสูบบุหรี่เชื่อมโยงกับมะเร็งปอดประมาณ 80 ถึง 90 เปอร์เซ็นต์ ซึ่งเป็นสาเหตุการเสียชีวิตด้วยโรคมะเร็งอันดับต้น ๆ ของทั้งชายและหญิง และมีส่วนทำให้เสียชีวิตจากโรคนี้ประมาณ 80 เปอร์เซ็นต์ การสูบบุหรี่เพิ่มความเสี่ยงมะเร็งปอด 5-10 เท่า โดยมีความเสี่ยงสูงกว่าในผู้สูบบุหรี่จัด การ สูบบุหรี่ยังสัมพันธ์กับมะเร็งในปาก หลอดลม กล่องเสียง หลอดอาหาร กระเพาะอาหาร ตับอ่อน ปากมดลูก ไต และกระเพาะปัสสาวะ รวมถึงมะเร็งต่อมน้ำเหลืองเฉียบพลัน การสูบบุหรี่ไม่ได้เป็นเพียงรูปแบบเดียวของการใช้ยาสูบที่เกี่ยวข้องกับมะเร็ง ยาสูบไร้ควัน  มีความเชื่อมโยงกับมะเร็งของคอหอย หลอดอาหาร กระเพาะอาหาร และปอด รวมทั้งมะเร็งลำไส้ใหญ่และไส้ตรงนอกจากมะเร็งแล้ว บุหรี่ การสูบบุหรี่ยังทำให้เกิดโรคปอด เช่น หลอดลมอักเสบเรื้อรังและถุงลมโป่งพอง และพบว่าทำให้อาการหอบหืดรุนแรงขึ้นในผู้ใหญ่และเด็ก การสูบบุหรี่เป็นปัจจัยเสี่ยงที่สำคัญที่สุดสำหรับโรคปอดอุดกั้นเรื้อรัง (COPD) สถิติการรอดชีวิตระบุว่าการเลิกบุหรี่ส่งผลให้ปอดเสียหายจากการสูบบุหรี่ได้เมื่อเวลาผ่านไป อย่างไรก็ตาม เมื่อ COPD พัฒนาขึ้น จะไม่สามารถย้อนกลับได้ ความเสียหายของปอดที่เกี่ยวข้องกับโรคปอดอุดกั้นเรื้อรังไม่ได้รับการซ่อมแซมตามเวลา