นับตั้งแต่ NIH เริ่มให้ทุนแก่โครงการ Human Microbiome Project (HMP) ซึ่งก่อตั้งขึ้นในปี 2550 สิ่งพิมพ์หลายฉบับมุ่งเน้นไปที่ลักษณะเฉพาะหน้าที่ และปฏิสัมพันธ์ที่ซับซ้อนของไมโครไบโอมที่เกี่ยวข้องกับส่วนที่เหลือของร่างกาย ความผิดปกติระหว่างไมโครไบโอมและโฮสต์นั้นเชื่อมโยงกับโรคต่างๆ รวมถึงมะเร็ง การเผาผลาญบกพร่อง ความผิดปกติของภูมิต้านทานผิดปกติ และโรคติดเชื้อ ไมโครไบโอม จำเป็นต้องมีความเข้าใจเพิ่มเติมเกี่ยวกับไมโครไบโอมและการมีปฏิสัมพันธ์กับโฮสต์ที่เกี่ยวข้องกับโรค เพื่อให้เข้าใจถึงผลกระทบของความผิดปกติของไมโครไบโอมและการใช้ไมโครไบโอต้าที่เป็นไปได้ในการป้องกันโรค